Nach der Rekonstruktion der Bühne im Jahr 2003 gehört das Theater zu den größten und modernsten seiner Art in Europa. Es verfügt über einen Saal mit 154 Plätzen und modernster Bühnentechnik, eine Probebühne sowie eine weitere kleine Spielstätte.
Pro Spielzeit kommen in der Regel sechs bis acht Neuinszenierungen zur Premiere. Es wird für Kinder und Erwachsene inszeniert.
Das Angebot des Magdeburger Puppentheaters besteht kontinuierlich aus 20 Inszenierungen.
Geschichten für die kleinsten Theaterzuschauer (ab 3 Jahren) gehören ebenso zum Repertoire wie klassische Märchen, fantastische Geschichten, Aktionstheater und Gegenwartsdramatik für größere Kinder.
Jahr für Jahr ist zunehmend mehr Interesse des erwachsenen Publikums an den Produktionen des Hauses oder den Gastspielen anderer Figurentheater zu verzeichnen. Ein regelmäßiger Abendspielplan für Erwachsene ist deshalb fester Bestandteil des Spielplans.
Legendär ist das jährliche Open air Sommertheater auf dem Innenhof des Puppentheaters. Das Hofspektakel, in seiner Art einmalig, ist ein Publikumsmagnet.
International bekannte Regisseure und Ausstatter sind regelmäßige Gäste des Hauses.